为使动物机体获得稳定的免疫力，选用适当的疫（菌）苗，安排在适当的时间给动物进行免疫接种，是当前养殖场控制动物疫病的唯一出路。在制定免疫程序时，应根据当地疫病的流行特点及规律、动物的年龄和用途、幼龄动物的母源抗体水平以及疫（菌）苗的种类、性质和接种途径等具体情况，制定养殖场科学合理的免疫程序。
（一）动物免疫接种的目的 一是提高动物抗病能力，减少病原感染动物群，阻断病原在场内循环传播。二是通过提高母猪体内的母源抗体来保护仔猪。三是在疫病发生早期，紧急大量接种相对应的疫苗，可以让动物在短期内产生较高抗体，以防止疫病在动物群中传播，达到迅速控制疫病的目的。
（二）免疫所需疫苗的选择 在生猪疫病防控过程中,可根据生猪疫病爆发期、散发期、扑灭期等不同过程选择使用不同的疫苗。一般来说，疾病爆发期，我们选用的是能迅速刺激猪只免疫力提升最快的疫苗，以达快速防疫的效果，这时活苗比灭活苗好，水性佐剂比油质佐剂优；疾病如果在散发期，我们选用保护时间长的疫苗，此时尽量选择活苗或油质佐剂的灭活苗较佳；而在进行扑灭期时，我们会选用标示疫苗和没有散毒危险的疫苗。活疫苗（冻干疫苗）优点是常在－15℃以下保存，产生的免疫力强，用量少，产生免疫力快。缺点也很明显，就是毒性高，安全性差。有些疫苗使用后会出现免疫后的猪给没有免疫的猪传播该病的散毒情况发生。灭活疫苗（油佐剂疫苗）2～8℃保存，禁止冻结,它同活疫苗正好相反，安全没有散毒的危险，同时受原有抗体特别是母源抗体的影响较小，大群使用产生的免疫水平比较整齐。缺点是产生的免疫力低而且需要的时间长，疫苗价格高。
（三）做好种猪群的免疫 改善种猪的免疫水平，减少甚至避免隐性感染，提高母源抗体水平，是释放仔猪免疫空间的重要手段。很多猪场被迫在仔猪断奶前打各种疫苗，是因为其猪群母源抗体偏低，对哺乳子猪保护力不够，被迫对产房里的仔猪进行多种疫苗接种，而造成严重的免疫应激。如果母猪伪狂犬病、口蹄疫等疫苗免疫做得好，母源抗体水平很高，仔猪在45日龄前受到充分保护，仔猪就无须在产房接种这两种疫苗。
（四）病毒疫苗优先免疫 到目前为止，对于病毒仍然没有任何特效药物，猪只抵抗病毒的感染最有效手段是机体的免疫系统。因此刺激机体产生针对病毒性病原的特异性免疫，即疫苗接种，是猪场控制病毒性疾病最为有效的办法。另外，蓝耳病病毒、圆环病毒、伪狂犬病病毒等病原本身可侵害肺部组织，引发严重的肺部病变，再加上继发的细菌感染，危害非常之大。因此，建议优先接种病毒性疫苗。
（五）合理选择细菌性疫苗 细菌性疾病的感染十分复杂，一些病原细菌的流行血清型十分复杂，然而不同血清型疫苗的交叉保护并不理想。因此在选择细菌性疫苗时，必须充分了解本场、本地区的疾病流行以及相关病原细菌血清型的流行情况，尽量做到不接种无效的细菌疫苗。
（六）药物保健控制细菌感染 控制细菌感染的药物在市场上可供选择的品种也很多。对于猪场常见细菌性病原而言，我们都可以找到合适的药物进行控制。猪场只要针对本场猪群常发生的细菌性疾病种类，选择质量好、敏感性高的药物，并严格执行生物安全措施，通常都能得到很好的控制效果。
