迁徙水鸟的粪便微生物群和抗生素抗性基因与栖息地利用对比,Science of the Total Environment
候鸟可能在抗菌素耐药性跨栖息地和地区的传播中发挥至关重要的作用，但实证数据仍然稀缺。我们调查了四种在西班牙西南部越冬的候鸟肠道微生物组组成和粪便中抗生素耐药基因 （ARG） 丰度的差异，这些水鸟的栖息地利用不同。白鹳 Ciconia ciconia 和小黑背鸥 Larus fuscus 是杂食性和机会主义鸟类，它们使用高度人为的栖息地，如垃圾填埋场和城市地区。灰雁 Anser anser 和普通鹤 Grus grus 是食草动物，使用更多的自然栖息地。分析来自每个物种的 15 个个体的新鲜粪便，以使用 16S rRNA 扩增子靶向测序评估细菌群落的组成，并使用 qPCR 量化 I 类整合子整合酶基因 （intI1） 的丰度以及编码对磺胺类药物 （sul1）、β-内酰胺类 （blaTEM、blaKPC 和 blaNDM）、四环素类 （tetW）、氟喹诺酮类 （qnrS） 和粘菌素 （mcr-1） 的耐药性基因。海鸥粪便中的细菌群落最丰富、最多样化。β 多样性分析显示鸟类物种之间的粪便群落存在隔离，但来自鹳和海鸥的物种最相似，它们是经常在垃圾填埋场觅食的物种。在粪便中鉴定出的潜在细菌病原体因鸟类而异，海鸥的相对丰度较高。在垃圾填埋场觅食的鸟类（鹳和海鸥）的粪便中含有明显更高的 ARGs（sul1、blaTEM 和 tetW）丰度。仅在海鸥的粪便中观察到对碳青霉烯类抗生素 （blaKPC） 和粘菌素 （mcr-1） 等最后手段抗生素产生耐药性的基因。 这些结果表明，这些鸟类是抗菌素耐药细菌的储存库，并表明水鸟可能会跨环境（例如，从垃圾填埋场到稻田或供水）传播抗生素耐药性，从而构成它们进一步传播给野生动物和人类的风险。
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