鱼类肠道微生物群落特征及季节间变化研究新进展
动物肠道内栖息着种类繁多、数量庞大的微生物群，它们与宿主相互依赖、相互制约，经长期进化，参与宿主营养代谢、生长发育和免疫应答等重要生理过程。与陆生生态系统相比，水生生态系统具有更高的动态性和空间异质性，为应对多变的栖息环境和食物来源，以鱼类为代表的水生动物肠道微生物群也更为多样和复杂。鱼类种类众多，揭示鱼类肠道微生物的群落结构和动态特征是一项艰巨的任务。
近期，水产所研究人员以巢湖为研究区域，选取鲢（Hypophthalmichthys molitrix）、鳙（Aristichthys nobilis）、鲤（Cyprinus carpio）、鲫（Carassius auratus）、短颌鲚（Coilia brachygnathus）、湖鲚（Coilia ectenes taihuensis）、翘嘴鲌（Culter alburnus）7种巢湖中代表性鱼类为研究对象，通过周年采样和肠道微生物16S rRNA基因V3–V4区高通量测序分析，系统研究了它们肠道微生物群落特征和季节动态。结果表明：7种鱼类微生物群落主要由气单胞菌属（Aeromonas） 、鲸杆菌属（Cetobacterium）、 梭状芽孢杆菌（Clostridium sensu stricto 1）、罗姆布茨菌属（Romboutsia）和假单胞菌（Pseudomonas）组成；同时，对鱼类微生物群落的共分布网络分析表明，与其他4种鱼类相比，鲫、鲤和短颌鲚的肠道微生物群落更复杂、更稳定；此外，梭状芽胞杆菌属、罗姆布茨菌属和假单胞菌等微生物不仅是鱼类肠道微生物群落中的优势类群，也是鱼类肠道微生物网络结构中的关键类群。肠道微生物群落特征存在显著的种间差异和季节性变化。
本项研究近日以《Variations and interseasonal changes in the gut microbial communities of seven wild fish species in a natural lake with limited water exchange during the closed fishing season》为题，发表在微生物学经典杂志《Microorganisms》，梁阳阳博士为论文第一作者。本研究得到国家特色淡水鱼产业技术体系（CARS-46）、安徽省水产产业技术体系（皖农科函〔2021〕711号）和安徽省重点研究与开发计划项目（2022107020008）联合资助。
文章连接：https://www.mdpi.com/2076-2607/12/4/800
图1 7种鱼类肠道微生物 α多样性指数
（注：a香农指数 ，b 逆辛普森指数，c观测丰富度，d Chao1指数）
图2 季节间鱼类肠道微生物 α多样性指数
（注：a香农指数 ，b 逆辛普森指数，c观测丰富度，d Chao1指数）
图3 巢湖七种不同鱼类肠道微生物群落的共生网络
（注：a 鲢，b 鳙，c鲫，d 翘嘴鲌，e短颌鲚，f 鲤，g湖鲚）
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