工厂化循环水养殖的实质是养殖生产的工业化，生产过程可控，可以跨季节养殖，产品像工业品一样可以有计划地均衡上市。其特点：一是用水量少，可利用较低质水源，对水资源要求较低；二是占地少，对土地资源的要求低；三是养殖密度高，单位耗水产量大；四是易于控制生长环境，鱼类(以及其他养殖种类)生长速度快，生长周期短；五是饲料利用率高；六是水循环使用，利用系数高；七是排放的废水废物少，能集中处理，对环境无压力或很小；八是不受外界气候的影响，可实现常年生产。
近些年来，随着水产养殖塘租、鱼种、药费、刮鱼人工等费用的增加，使得养殖成本的大大提高，很多水产养殖户为了降低成本，便开始加大放养密度。高密度养殖能够带来更高收益的同时也带来难以解决的危害，很多水产养殖户都不同程度上出现了养殖池亚*酸盐过高的现象。养殖池亚*酸盐过高会引发一系列问题，例如：造成鱼黑鳃、鳃肿、烂鳃，严重时大量死鱼；增氧不够或天气差时，鱼容易缺氧浮头；导致鱼吃料变差，且容易出现肠炎；刮鱼时容易出现“白身”、“烧尾”、“硬骨”等问题。而高密度养殖会增加处理亚*酸盐的难度，很多养殖户连泼2-3次降亚*酸盐药都不见效果。
循环水系统处理的对象一般是含有大量固体悬浮物或溶解性的物质，这些物质排入到养殖水中后会在细菌的作用下，分解成氨、硫化氢等对水生动物有毒的物质。因此，一时间将这些污染物截留并尽可能地将这些污染物变废为宝，是循环水处理系统的功能所在。循环水处理系统首先包括机械过滤部分。这些设备会将水中的固体悬浮物在一时间过滤出来。经常用到的设备是蛋白质分离器、微滤机、精密过滤器等设备。其次，循环水处理系统还有生化过滤设备。这些设备是为了培养相应的微生物来对水中溶解性物质进行分解分离的。
